1997年9月，中国外轮理货总公司宜昌分公司在宜昌港成立并投入营运。

　1998年7月，经湖北省人民政府批准，宜昌港二类水运口岸正式对外开放，宜昌港口岸联检中心挂牌。年度集装箱吞吐量完成3076标箱，外贸进出口量由长江沿线港口第25位跃升至第6位，跻身湖北省水运口岸“二强”之列 。

　1999年4月，50吨浮吊正式定点作业，口岸集装箱码头通过能力增强，同年荣获省级“文明口岸”光荣称号。

2000年集装箱吞吐量2212标箱。

2001年荣获省级“文明口岸”光荣称号，年度集装箱吞吐量2012标箱。

2002年集装箱吞吐量3173标箱。

2003年11月，水运口岸集装箱新码头（专用集装箱泊位2座，40吨门式起重机一台，件杂货码头一座）通过验收正式启用。荣获省级大通关先进单位、省级“文明口岸”称号，年度集装箱吞吐量4404标箱。

　2004年，集装箱管理系统交付使用，年度集装箱吞吐量7453标箱。

　2005年，新增堆场面积7000平方米，货物中转堆存仓库交付使用，荣获省级“文明口岸”称号，年度集装箱吞吐量12075标箱。

　2006年，集装箱吞吐量20757标箱。

　2007年，集装箱吞吐量31789标箱。

　2008年，集装箱吞吐量42496标箱。

　2009年11月，宜昌市财政局对从宜昌口岸开通的始发集装箱班轮开始实施财政专项资金奖励；年度集装箱吞吐量10118标箱。

　2009年，集装箱吞吐量44455标箱。

　2010年，集装箱吞吐量53586标箱。

　2011年，集装箱吞吐量61080标箱。

　2012年9月，云池作业区监管场所通过武汉海关现场验收；10月，云池作业区获得中华人民共和国武汉海关监管场所注册登记证书，原十四码头作业区海关监管场所注销；同年荣获“省级文明口岸”荣誉称号，年度集装箱吞吐量76260标箱。

　2013年1月，宜昌市商务局、财政局出台《宜昌水运口岸集装箱始发班轮专项奖励办法》，扩大了奖励范围，提高了奖励标准，为宜昌水运口岸始发班轮开行和增加密度提供了政策保障和有力支持；8月，宜昌水运口岸（云池港）推介会隆重举行，市政府领导及市直相关部门、各县市区商务局、船货代公司和外贸企业代表共100余人参加；年度集装箱吞吐量103,028标箱，成为湖北省第二个突破10万标箱的水运口岸。

　2014年4月，宜昌水运口岸取得热处理资质，热处理库正式启用；年度集装箱吞吐量125896标箱。

　2015年3月，码头无线终端系统投入运营，有效降低人工操作失误率、提高效率，大大改善港口运营环境；年度集装箱年吞吐量130519标箱。

　2016年5月，武汉长伟及上海锦钰两家船公司与口岸开展始发班轮合作，始发班轮共达409航次，平均每周8个航次，实现“天天班”；10月，取得集装箱内外贸同船运输资质，口岸通关效率进一步提高；年度集装箱年吞吐量150600标箱。

2017年8月，宜昌市政府副市长周正英赴云池港调研宜昌港开放工作，宜昌港口岸开放升级工作全面启动；10月，中外运湖北公司第三条“宜昌—武汉”始发班轮在宜昌云池港水运口岸启航；12月，海关H986大型集装箱检查设备安装项目在云池港顺利通过验收；年度集装箱年吞吐量突破17万标箱。

   2018年2月，云池港列入启运港退税政策范围；7月，长江宜昌段首个货运码头船舶岸电供电桩落地云池港；11月，宜昌港华物流与中谷海运、驿动天下物流（湖北）有限公司及武汉铁路局宜昌车务段合作，开辟了南昌-宜昌-成都（重庆）集装箱铁水联运线路；年度集装箱年吞吐量151800标箱。

2019年8月，宜昌市委书记周霁到云池港调研全市港口物流产业集聚发展情况，听取港口运行情况汇报，强调要充分发挥水运口岸作用，推动宜昌外向型经济实现更好发展；11月，云池港开辟“宜昌-重庆”集装箱始发班轮航线并举行首航仪式。

      2020年初，新冠肺炎疫情袭来，云池港开通的绿色运输通道让防疫物资及民生物资得以顺畅流通，为枝江奥美医疗、兴发化工、安琪酵母等“停不得”企业忙不停，有效保障了本地外贸进出口企业需求，充分发挥了水运口岸功能；6月，云池港打通东部沿海至渝东南水公铁路联运新通道；8月，“车阳河港-云池港”小支线始发航班开通，开辟了鄂西片区货物物流新通道。